1993年8月，乔丹的父亲詹姆斯-乔丹遇害，震惊了全世界。尽管警方最后判定这是一次随机杀人事件，但还是有很多阴谋论喧嚣尘上。
首先是尸体的处理问题，老乔丹是在北卡罗来纳州遇害，但是尸体被抛到了南卡罗来纳边界的地方，这或许可以理解为凶手抛尸。但是美国警方在还没有确认死者身份的情况下就草草将其火化，这十分耐人寻味。其次，老乔丹失联将近20天，其中7月31日还是他57岁的生日，但他们一家居然没有注意到老乔丹失踪了，也没有跟警察报警。
乔丹期间还参加了两场高尔夫慈善赛，他的母亲和姐姐也没有任何反应。至少从正常人的角度来说，自己的亲人失联那么久，怎么样都会有所警觉。最后就是乔丹欠赌债不还导致父亲被害的阴谋论，恰好之前一年，乔丹一直都深陷赌博的麻烦，从被NBA通报批评到，季后赛凌晨流连赌场被抓拍，再到被债主出书披露乔丹欠债不还。
飞人乔丹已经和赌博产生了密不可分的联系，因此，当老乔丹遇害时外界再次把这两者联系在了一起。但其实并没有什么实质性的证据，1993年8月15日，乔丹一家为詹姆斯乔丹举办了追悼仪式，教堂里里外外挤满了人。乔丹对着台下200多位来宾发表演讲，饱含深情地回忆起了父亲的品质，对自己的抚养和教育。